家柄の低い秀吉は、多くの合戦で手柄を立てながらも織田家の中で最も下に扱われていた。よって「自分がトップに躍り出るのは難しい」と考えた秀吉は一発逆転を狙って信長の暗殺を企てた、秀吉が光秀をけしかけて信長殺害を実行させた
……というのが山岸氏が説く秀吉黒幕説です。「タイミングを計ったように素早く敵対する毛利と和睦を結び、ありえないスピードの中国大返しで都に帰還した彼の行動も、容易に説明できます」「明智光秀を討った山崎の戦いは、謀反の責任を光秀に押し付ける口封じのためとも解釈できます」とも山岸氏は述べています（「本能寺の変『本当の裏切り者』は誰なのか 教科書が教えない『明智光秀』以外の真犯人」）。
「素早く敵対する毛利と和睦を結び、ありえないスピードの中国大返しで都に帰還した」秀吉の動きは不自然だということが、秀吉黒幕説の「論拠」になっていることがわかります。この中国大返しの「不自然さ」を秀吉黒幕説の論拠にしている論者はそれなりにいます。
では、秀吉はなぜ信長を殺そうとしたのか。それを天下人になりたいという秀吉の野心に求める論者もおります（吉川哲史「本能寺の変には黒幕がいた？ 秀吉の野望編」）。
江戸時代からあった「秀吉黒幕説」
筆者は、秀吉黒幕説はありえないとする立場です。その理由については後述しますが、実は秀吉黒幕説（秀吉が光秀に謀反をけしかけるようなことを述べる）というのは江戸時代から見られるものでした。
江戸時代に成立した徳川家の歴史を記した『三河後風土記』（史料的価値は低い）には次のような逸話が収録されています。
斎藤利三は最初、稲葉伊予守通朝（稲葉一鉄）に仕えていたが、そりが合わず、斎藤は光秀に仕えるようになります。それが不満だった稲葉は光秀に斎藤を返してほしいと申し送り、それが叶うことになりました。
ところがまたしても斎藤は稲葉から逃げ出し、光秀のもとに走ります。稲葉は斎藤を呼び返そうとしますが、光秀は斎藤を「返さない」と返答したのです。これに怒った稲葉はこの件を信長に訴えます。信長は光秀に対し「何故に（斎藤）を返さないのか」とお怒りになりました。
